生物肥料是活体肥料，它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活动来完成。只有当这些有益微生物处于旺盛的繁殖和新陈代谢的情况下，物质转化和有益代谢产物才能不断形成。因此，微生物肥料中有益微生物的种类、生命活动是否旺盛是其有效性的基础，而不像其它肥料是以氮、磷、钾等主要元素的形式和多少为基础。正因为微生物肥料是活制剂，所以其肥效与活菌数量、强度及周围环境条件密切相关，包括温度、水分、酸碱度、营养条件及原生活在土壤中土著微生物排斥作用都有一定影响，因此在应用时要加以注意。
生物有机肥生产技术是在畜禽粪便及其他有机物料中添加生物菌剂，经生物发酵处理，有益微生物扩繁，从而达到畜禽粪便彻底脱臭、腐熟、杀虫、灭菌的无害化、商品化处理目的，该技术特别适合养殖场、种植基地及养殖业集中地进行畜禽粪便加工。由于处理过程物料得到了彻底的腐熟，施到地里不会产生二次发酵，不会因发生二次发酵中快速繁殖的微生物和作物根系争氧而产生烧根烧苗现象，使用可靠。
生物有机肥发酵方法
1）发酵原料：新鲜的畜禽粪便、辅料（蘑菇渣）。
2）工具：搅拌机、机械翻倒机、铁锹。
3）发酵菌种：生物有机肥专用发酵菌种。
4）配比：畜禽粪便1000公斤，有机肥发酵剂菌种100克。
5）操作流程：将畜禽粪便按照配比与辅料、发酵剂菌种用搅拌机充分搅拌后堆成高50厘米，宽100厘米的长方形物料堆，插入温度计，等温度达到70℃以上两天后，用翻倒机翻堆；物料温度升至60℃两天后再次翻堆；依此类推反复翻至正常温度到畜禽粪彻底腐熟，腐熟后造粒、风干、装袋。
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